Rafael Silva-Rocha, Professor Associado, FMRP-USP
- Fone: (16) 99336-4881 E-mail:silvarochar@gmail.com Currículo Lattes
- Linhas de Pesquisa:
- Através do desvendamento dos mecanismos de regulação gênica, o grupo alveja a formação de novos conceitos e a construção de novas ferramentas para a engenharia de circuitos regulatórios em células vivas, visando diversas aplicações biotecnológicas. Para tanto, o grupo utilizada uma combinação de ferramentas de biologia molecular juntamente com abordagens computacionais para abordar diversos aspectos da regulação gênica, utilizando para tanto desde de a construção e caracterização de mutantes, a caracterização de promotores fusionados ao gene repórter GFP, análise bioinformática de genomas e transcritomas e até mesma a elaboração de modelos matemáticos visando a descrição dos fenômenos de interesse. Dada a grande complexidade e multidisciplinariedade dos trabalhos realizados, estudantes de diferentes árias do conhecimento (biologia, química, física, matemática, informática, etc.) são de interesse para o grupo. Assim, as principais linhas de pesquisa do grupo são:
- Desenvolvimento de novas ferramentas genéticas para microrganismos:
Visa o desenvolvimento de novas técnicas e ferramentas para a manipulação genética de organismos vivos, focando principalmente na construção e caracterização de vetores modulares otimizados para bactérias gram-negativas e fungos filamentosos. - Biologia Sistêmica:
Visa o estudo das propriedades das redes regulatórias dos organismos de interesse através da utilização da bioinformática e da biologia computacional para integrar dados de larga escala, principalmente de genômica estrutural e funcional e de transcritomas. - Biologia Sintética:
Visa o desenho, construção e caracterização de novos circuitos regulatórios através da utilização de partes biológicas e de modelos computacionais com o objetivo de redesenhar microrganismos para aplicações biotecnológicas.
- Desenvolvimento de novas ferramentas genéticas para microrganismos:
- Através do desvendamento dos mecanismos de regulação gênica, o grupo alveja a formação de novos conceitos e a construção de novas ferramentas para a engenharia de circuitos regulatórios em células vivas, visando diversas aplicações biotecnológicas. Para tanto, o grupo utilizada uma combinação de ferramentas de biologia molecular juntamente com abordagens computacionais para abordar diversos aspectos da regulação gênica, utilizando para tanto desde de a construção e caracterização de mutantes, a caracterização de promotores fusionados ao gene repórter GFP, análise bioinformática de genomas e transcritomas e até mesma a elaboração de modelos matemáticos visando a descrição dos fenômenos de interesse. Dada a grande complexidade e multidisciplinariedade dos trabalhos realizados, estudantes de diferentes árias do conhecimento (biologia, química, física, matemática, informática, etc.) são de interesse para o grupo. Assim, as principais linhas de pesquisa do grupo são:
Rafael Silva-Rocha, Professor Associado, FMRP-USP
- Teléfono: (16) 99336-4881 Correo electrónico:silvarochar@gmail.com Lattes curriculares
- Líneas de investigación:
- A través del descubrimiento de mecanismos de regulación genética, el grupo apunta a la formación de nuevos conceptos y la construcción de nuevas herramientas para la ingeniería de circuitos reguladores en células vivas, con el objetivo de diferentes aplicaciones biotecnológicas. Para ello, el grupo utilizó una combinación de herramientas de biología molecular junto con enfoques computacionales para abordar diversos aspectos de la regulación génica, utilizando para ello desde la construcción y caracterización de mutantes, la caracterización de promotores fusionados al gen reportero de GFP, análisis bioinformático. de genomas y transcriptomas e incluso la elaboración de modelos matemáticos que apunten a la descripción de los fenómenos de interés. Dada la gran complejidad y multidisciplinariedad del trabajo realizado, los estudiantes de diferentes áreas del conocimiento (biología, química, física, matemáticas, tecnologías de la información, etc.) son de interés para el grupo. Así, las principales líneas de investigación del grupo son:
- Desarrollo de nuevas herramientas genéticas para microorganismos:
Tiene como objetivo desarrollar nuevas técnicas y herramientas para la manipulación genética de organismos vivos, centrándose principalmente en la construcción y caracterización de vectores modulares optimizados para bacterias gramnegativas y hongos filamentosos. - Biología sistémica:
Tiene como objetivo estudiar las propiedades de las redes reguladoras de organismos de interés mediante el uso de la bioinformática y la biología computacional para integrar datos a gran escala, principalmente de la genómica y transcriptómica estructural y funcional. - Biología sintética:
Tiene como objetivo el diseño, construcción y caracterización de nuevos circuitos reguladores mediante el uso de partes biológicas y modelos computacionales con el fin de rediseñar microorganismos para aplicaciones biotecnológicas.
- Desarrollo de nuevas herramientas genéticas para microorganismos:
- A través del descubrimiento de mecanismos de regulación genética, el grupo apunta a la formación de nuevos conceptos y la construcción de nuevas herramientas para la ingeniería de circuitos reguladores en células vivas, con el objetivo de diferentes aplicaciones biotecnológicas. Para ello, el grupo utilizó una combinación de herramientas de biología molecular junto con enfoques computacionales para abordar diversos aspectos de la regulación génica, utilizando para ello desde la construcción y caracterización de mutantes, la caracterización de promotores fusionados al gen reportero de GFP, análisis bioinformático. de genomas y transcriptomas e incluso la elaboración de modelos matemáticos que apunten a la descripción de los fenómenos de interés. Dada la gran complejidad y multidisciplinariedad del trabajo realizado, los estudiantes de diferentes áreas del conocimiento (biología, química, física, matemáticas, tecnologías de la información, etc.) son de interés para el grupo. Así, las principales líneas de investigación del grupo son: